Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TP20293 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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TP20293 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TP20293 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TP20293 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TP20293 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TP20293 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TP20293 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TP20293 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TP20293 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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