Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P20040 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P20040 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P20040 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms