Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18533 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18533 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P18533 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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