Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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