Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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PcnaP17918 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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PcnaP17918 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PcnaP17918 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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