Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa-rs1P17533 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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