Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rag1P15919 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms