Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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