Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Vpreb2P13373 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms