Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
OtcP11725 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
OtcP11725 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
OtcP11725 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
OtcP11725 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
OtcP11725 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
OtcP11725 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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