Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hoxd4P10628 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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