Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb3P09026 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxb3P09026 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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