Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06344 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P06344 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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P06344 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P06344 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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P06344 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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P06344 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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P06344 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06344 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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P06344 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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P06344 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06344 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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