Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
DffaO54786 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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