Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Opn1mwO35599 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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