Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KeraO35367 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KeraO35367 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
KeraO35367 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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