Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Taf4bG5E8Z2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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