Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Srp72F8VQC1 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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