Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ScaperF8VQ70 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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