Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms