Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17555F6U8B9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms