Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Myo5cE9Q1F5 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo5cE9Q1F5 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1803.3 ms