Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Calhm1D3Z291 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Calhm1D3Z291 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms