Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6685D3YYP3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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