Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmf1B9EKI3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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