Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt4B2RU40 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms