Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pramef6A2A8M8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms