Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PtprfA2A8L5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
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PtprfA2A8L5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
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PtprfA2A8L5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PtprfA2A8L5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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