Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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