Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms