Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms