Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn9Q9Z0S7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn9Q9Z0S7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn9Q9Z0S7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms