Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cldn13Q9Z0S4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms