Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nme3Q9WV85 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms