Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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