Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PolkQ9QUG2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms