Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col5a3Q9JLI2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms