Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Nlrp9b-202ENSMUST00000117909 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Olfr631-201ENSMUST00000106863 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ms4a4bQ9ES61 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms