Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms