Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Clstn1Q9EPL2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clstn1Q9EPL2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms