Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Med27Q9DB40 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Med27Q9DB40 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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