Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms