Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc83Q9D4V3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms