Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trmt44Q9D2Q2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trmt44Q9D2Q2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms