Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms