Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cysrt1Q9D1E4 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cysrt1Q9D1E4 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cysrt1Q9D1E4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cysrt1Q9D1E4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cysrt1Q9D1E4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cysrt1Q9D1E4 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cysrt1Q9D1E4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cysrt1Q9D1E4 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms