Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc47Q9D024 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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