Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpusd4Q9CWX4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms