Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fcf1Q9CTH6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms