Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Chmp3Q9CQ10 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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